Τα όργανα της Κάριτας Αθήνας είναι:
Η Γενική Συνέλευση
Το Διοικητικό Συμβούλιο
Η Εξελεγκτική Επιτροπή
ΔΙΟΙΚΗΤΙΚΟ ΣΥΜΒΟΥΛΙΟ
Tο Σωματείο διοικείται από 7μελές Διοικητικό Συμβούλιο, 4ετούς θητείας.
Η σύνθεσή του, μετά τις αρχαιρεσίες της 11ης Δεκεμβρίου 2020 έχει ως εξής:
ΠΡΟΕΔΡΟΣ: Αρχιεπίσκοπος Καθολικών Αθηνών π. Θεόδωρος Κοντίδης
ΑΝΤΙΠΡΟΕΔΡΟΣ & ΔΙΕΥΘΥΝΤΗΣ: π. Γιώργος Ντάγκας
ΓΡΑΜΜΑΤΕΑΣ: Ελισσάβετ Ιουστινιανού-Mέρριττ
ΤΑΜΙΑΣ: Στανίσλαος Στουραΐτης
ΜΕΛΗ:
π. Παύλος Σινιγάλιας
Νικολέττα Δελατόλα
Γιώργος Δ. Βακόνδιος
ΕΞΕΛΕΓΚΤΙΚΗ ΕΠΙΤΡΟΠΗ
π. Αλέκος Ψάλτης
αδ. Άννα-Μαρία Πρίντεζη
ΕΚΠΡΟΣΩΠΟΙ ΣΤΗΝ ΚΑΡΙΤΑΣ ΕΛΛΑΣ:
Δύο από τα μέλη του Δ.Σ. προτείνονται από το Σώμα και ορίζονται από τον Πρόεδρο να εκπροσωπούν την Οργάνωση στο Διοικητικό Συμβούλιο της Κάριτας Ελλάς.
Για την τρέχουσα 4ετία έχουν οριστεί ο Αντιπρόεδρος & Διευθυντής π. Γιώργος Ντάγκας και το μέλος Ελισσάβετ Ιουστινιανού - Μέριττ.